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Lambda病毒架构终于呈现

时间:2021-09-21 10:58:00来源:

兰德拉机。棕色和钢笔的研究人员已经产生了DNA蛋白复合物的描述,Lambda病毒用于将其DNA插入或从大肠杆菌宿主中插入或提取。这是插入者的渲染。亚瑟兰迪等。 al./brown大学

经过50多年的研究,生物学家现在具有允许λ病毒从其感染的细胞中插入或去除DNA的分子机器的照片。

普罗维登斯,罗德岛(棕色大学) - 半个世纪的生物学家研究了Lambda病毒公园DNA在宿主大肠杆菌细菌的染色体中DNA,后来提取它作为遗传重组的模型反应。但总而言之,它们永远无法产生蛋白质-DNA机器的整体描述,该机器正在进行工作。在国家科学院的一对背面论文中,科学家们生产了那些长寻求的渲染,并描述了他们如何看出它们所应该的样子。

棕色大学的研究人员团队和宾夕法尼亚州大学映射了机器中的重组蛋白在沿宿主和病毒的DNA桥接分开的部位。了解这意味着什么是欣赏λ病毒的进化“聪明才智”,该病毒已经成为50年的兴趣研究。谢天谢地,Lambda是良性的,虽然它有着医学上的讨厌的表兄弟,那么工作就像一样的方式。

Lambda表示,与棕色的生物学教授arthur Landy表示,兰布尔·兰迪(Brown)教授不是那些只是粉碎并抓住宿主以立即繁殖的魔鬼可能的病毒之一。相反,它感测其大肠杆菌宿主的生理学,并在引人注目之前等待细胞保持健康,可能稍后几代细胞键。要执行这种更精细的策略,它可以组装蛋白质的整体 - 一个“机器” - 将其DNA插入到宿主DNA的精确位置(以确保其DNA适用于许多世代的宿主细胞),另一个机时的理想宿主健康的选择的时刻到来提取DNA。

“当他们感染细胞时,病毒就是一个”决定“,以便这是粘合细胞的好时机,并制作更多的病毒,或者更少于将它们的染色体整合到大肠杆菌染色体中,转弯兰迪说,他们从他们的基因上坐在那里坐在那里。“然后,当事情再次看起来很好,他们使用不同但相关的途径来消除染色体,以便制作更多的病毒并杀死细胞。”

Lambda检测到主机的健康状况的方式建立在机器中。该机器包含由大肠杆菌制成的关键DNA弯曲蛋白来调节其自身基因的表达。因此,这些蛋白质的水平也反映了细胞的生理状态,兰迪说。虽然一些重组蛋白在每种DNA中的一个位点结合,但λ及其ILK通过锁定在DNA中的两个远处位点的麻烦。原因是使整个反应依赖于存在这些关键的DNA弯曲蛋白质以使部位弯曲更近。没有那些蛋白质,机器不能工作。

“它使系统免费依赖于细胞的蛋白质,作为记者的记者,即在其生命周期中的生命周期有多好,”兰迪说。“这使得它使其对细胞的生理学敏感。”

映射桥梁

生物学家已经知道这一切,但它们从未完全pd,机器中的重组蛋白质如何桥接两个DNA位点,(即,哪些位点被相同的重组蛋白结合或桥接)。因此,他们无法真正看出整个机器看起来像什么。直接成像工具,如晶体学曲线从未在整个机器上工作,因为它具有太多的形式,兰迪说,核磁共振从未工作过,因为它太难以足够高的机器以足够高的浓度制作。

因此,该团队对POUT桥接进行了几个其他实验。一种二手化学品和其他使用的遗传学,但在每种情况下,它们基本上标记蛋白质和DNA上的不同成对的位置,以看看是否有任何这些对连接,将产生讲述效果:在化学的情况下,讲述是复合物结构性质的变化;在遗传学的情况下,它是一个成功的整合或切除反应。

这有点像试图将电池连接到一个灯泡电路中,其中有很多松动的线,但只有两个实际连接到灯泡。当一个人最终连接(或“桥梁”)时,两个正确的松动导线与电池的电极,灯泡灯和并确认正确两根线的位置。

它们结合了他们的新映射,包括使用荧光标签的蛋白质-DNA复合物中的距离测量,所有其他生物化学和结构信息生物学家在过去的50年里学到了一台计算机模型,以渲染机器的整体描绘。

他们在进一步的研究中证实,他们产生的模型解释并同意了机器的大部分观察到的行为。

所以现在,很久以来,他们开始了解兰德瓦病毒是多么值得研究,研究人员终于看到了这些模型的DNA插入和移除机器的样子。Landy说,该信息将用于使Lambda成为研究和教学更强大的模型。

专注于桥接桥梁的纸张的引导作者是文君塘和大卫沃伦。其他棕色作者,除了Landy是妮可Seah和Gurunathan Laxmikanthan。Penn的联合对应作者是Gregory Van Duyne。

Seah是纸张的主要作者,解决了机器的整体架构。沃伦,佟和laxmikantanan是共同作者,van duyne又是一个与会共同作者。

国家卫生研究院支持这项研究(补助金:GM062723,GM033928和GM108751)。

刊物:

Wenjun Tong,等,“在核蛋白素Hollideλ结合中间映射病毒一般性和耐效性重组中间体的中间酶桥,”2014年PNAS; DOI:10.1073 / PNAS.1413007111NICOLE E. Seah等人,“调节病毒集成和切除方向性的核蛋白架构”,2014年PNAS; DOI:10.1073 / PNA.1413019111

图像:亚瑟兰迪等。 al./brown大学

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